Z tyłu kościoła znajduje się kruchta międzywieżowa, a nad nią chór muzyczny. Znajdujący się na chórze prospekt organowy wykonano w l pół. XVII w., same organy pochodzą z ok. 1900 r.
Późnorenesansowa rzeźbiona balustrada chóru została ufundowana przed 1625 r. przez opata Andrzeja Wilczyńskiego (jego herb Poraj widnieje w środkowym polu). Wtórnie umieszczono na niej dwie póżnogotyckie rzeźby świętych.